Родился в районе Файф, учился в университете в Ст.Эндрюс, куда поступил в 11 лет. В возрасте 23 лет он был священником и одновременно преподавателем науки в университете. В 1815 году он становится приходским священником в церкви Трон в Глазго. В новом индустириальном обществет его христианской доктриной были образование, социальная сфера и благотворительность. Он реорганизовал систему приходской помощи бедным, образовывал новые школы и церкви в районах. Он много писал, а проповеди по случаю в Лондоне сделали его еще более знаменитым.

В 1823 году он стал руководителем кафедры Философии морали в университете Ст.Эндрюс, а в 1833 году становится профессором теологиии в Университете Эдинбурга.

В 1832 Чалмерс становится председателем собрания Церкви Шотландии. В результате несогласия с некоторыми положениями внутри церкви он создал Свободную Церковь Шотландии, которая благодаря его организаторскими способностям стала второй по величине в Шотландии. У священников этой церкви не осталось церквей и домов, но буквально через два года было построено 500 новых церквей так же как и школ.